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Qual è il test per scoprire se sono infetto da CoV-2-SARS?

Testo aggiornato al 2020-04-30


Per scoprire se qualcuno ha preso il virus SARS-CoV-2, si può cercare la presenza del materiale genetico specifico per questo virus. Poiché la sequenza genetica del virus SARS-CoV-2 è nota, test RT-qPCR sono stati sviluppati e convalidati dall'OMS. Tuttavia, questi non rilevano il 100% dei casi di infezione. I test sulla saliva sono promettenti perché sono più sensibili e facili da usare. Il test PCR è: 1) da effettuare  presto (per limitare i falsi negativi), 2) da effettuare indipendentemente dalla gravità dei sintomi (secondo una strategia di salute pubblica e non individuale), 3) se i segni clinici della presenza del virus sono forti, si raccomanda l'isolamento anche se il test è negativo.

I test per individuare il SARS-CoV-2 si basano su una tecnica che rileva il materiale genetico del coronavirus SARS-CoV-2 mediante reazione a catena della polimerasi (PCR).

Che cosa viene prelevato per rilevare la presenza del coronavirus? I test attuali sono tipicamente eseguiti su campioni nasofaringei prelevati utilizzando un tampone, inserito abbastanza in profondità nella cavità nasale. Il virus è presente anche nelle feci, ma in piccole quantità. Recentemente, i test basati sulla saliva si sono rivelati più sensibili perché la carica virale è elevata nella saliva. Poiché i campioni associati sono molto facili da raccogliere, i test dell'espettorato sono molto promettenti per testare rapidamente una gran parte della popolazione. Inoltre, combinando in un unico test campioni provenienti da più persone della stessa famiglia, si potrebbe rendere più efficace l'individuazione di focolai infetti nella popolazione.

Come possiamo rilevare il virus? Il trattamento dei campioni, siano essi rinofaringei, salivare o fecali, inizia con l'inattivazione del virus, prima dell'estrazione del materiale genetico del virus, l'RNA. Per l'analisi della saliva, i campioni sono fluidificati. In Francia, il protocollo di rilevamento dell'RNA del virus si basa quindi su un'amplificazione di tipo RT-qPCR a un passo, sviluppata presso il centro nazionale di riferimento dell'Institut Pasteur e dell'Organizzazione Mondiale della Sanità. L'amplificazione RT-qPCR si rivolge a due regioni specifiche del virus e a una regione genomica specifica per le cellule del paziente in un "gene domestico". Questa sequenza umana permette di convalidare sia l'origine del campione che la qualità dei campioni e di standardizzarli l'uno rispetto all'altro. In questo modo si evita di avere numerosi falsi negativi legati a un cattivo campione. Una gamma standard di RNA virale sintetico permette di quantificare nei campioni il numero di molecole di RNA di SARS-CoV-2. In totale, occorrono circa 4 ore dall'inizio dell'elaborazione del campione al risultato del test in laboratorio.

Il test indica la presenza di materiale virale solo durante l'infezione. Una persona che ha preso il virus ed è poi guarita sarà negativa al test RT-qPCR. Tuttavia, potrebbe essere positiva ad un altro test, il test sierologico. Il test RT-qPCR dovrebbe quindi essere eseguito inizialmente, indipendentemente dalla gravità dei sintomi.

Falsi negativi. In alcuni pazienti COVID-19 il virus non è stato rilevato nelle secrezioni nasofaringee mentre era presente nei fluidi polmonari. Questi casi di falsi negativi indicano che il virus può rimanere nell'organismo senza essere necessariamente presente nelle secrezioni nasali o orali utilizzate per i test. Inoltre, se il campione viene prelevato in modo errato, è possibile che risulti negativo anche se la persona è infetta. Quindi, anche se il test è negativo, il virus può essere presente e l'isolamento necessario, secondo le indicazioni cliniche.


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Fonti

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Le misurazioni sulla saliva sono più sensibili dei test rinofaringei.

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Raggruppare i campioni di una famiglia potrebbe ottimizzare l'individuazione di focolai infetti nella popolazione.

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